首要，我們要了解的是，薄膜蒸發器與分子蒸餾同歸于液液別離設備，但二者作業原理有所不同。

薄膜蒸發器與旋轉蒸發儀一樣，歸于長程蒸餾，理論根據是沸點差。即在真空狀態下，經過刮板將物料攤開，加速物料中輕組分的蒸發。蒸發的氣體在真空的壓力作用下進入到冷凝收回設備中冷凝收回。

分子蒸餾則歸于短程蒸餾，根據的是分子平均自由程差。在高真空狀態下，使蒸氣分子的平均自由程大于蒸發外表與冷凝外表之間的間隔，然后可利用料液中各組分蒸發速率的差異，對液體混合物進行別離。

其次，從結構上看，主要有兩點差異：

1、分子蒸餾設備主蒸發室有一個內置冷凝器，而薄膜蒸發器沒有；

2、薄膜蒸發器的氣相出口在蒸發器上端，以滿意輕組分的蒸汽自下而上流動的規律；分子蒸餾則相反，其氣相出口在蒸發器下端，這是因為輕組分要充分在內置冷凝器上進行冷凝。

結構上的差異，決議了二者具體功用的不同：

1、分子蒸餾在作業條件下的真空度要高于薄膜蒸發器，這使操作溫度有了下降空間，更有利于熱敏性物料的別離；

2、利用沸點差別離過程中，蒸發和冷凝是可逆過程，液相和氣相之間處于動態相平衡；而分子蒸餾過程中,分子從加熱面逸出的分子直接飛射到冷凝面上，所以對它來說沒有約束。分子蒸餾相對薄膜蒸發器別離精準度也更高；

3、總的來說，薄膜蒸發器能做的實驗，分子蒸餾都能進行，而分子蒸餾能進行的薄膜蒸發器不一定適用。

那么在選型時，應該注意哪些具體因素呢？

首要，需要判斷實驗或出產的需求，假如二者均能滿意，則薄膜蒸發器在價格和設備維護上均具備顯著優勢；但是，假如關于功用性有特別要求，非分子蒸餾不能滿意，則千萬不能為了圖便宜，挑選過錯的設備，給實驗或出產帶來不必要的損失。